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当你使用 Buildroot 构建 Linux 内核时，如果对内核文件进行了手动修改，重新执行 Buildroot 的构建过程将会覆盖你所做的修改。这是因为 Buildroot会根据配置重新下载、提取和编译内核。

为了避免在重新构建时覆盖你的修改，可以采取以下两种方法之一：

1. 使用外部内核源码：将你的自定义内核源码放置在 Buildroot 之外的目录，并通过 Buildroot 的配置选项指定该源码的路径。这样，在重新构建 Buildroot 时，它将跳过内核的下载和提取步骤，直接使用你提供的源码进行编译。你可以继续在外部目录中进行自定义修改，并且这些修改不会被 Buildroot 覆盖。

   在 Buildroot 的配置界面 (make menuconfig) 中，找到 “Kernel” 选项，然后指定 “Custom source” 选项为你的内核源码路径。确保选择了 “Use a custom kernel configuration” 选项，以便使用自定义的内核配置。

2. 使用 Buildroot 的补丁机制：如果你只需要对内核做一些小的修改，你可以使用 Buildroot 的补丁机制。通过在 Buildroot 中应用补丁，可以修改内核源码中的特定部分，而不会影响其他构建步骤。

   在 Buildroot 的 board/<board_name>/linux 目录中，你可以创建一个补丁文件（例如 my_kernel.patch），其中包含你的修改。然后，在 Buildroot 的配置界面中，找到 “Kernel configuration” 选项，并指定 “Path to the patch series” 为你的补丁文件路径。这样在重新构建 Buildroot 时，它将应用你的补丁，并在内核编译过程中包含你的修改。

使用上述方法之一，你可以在重新构建 Buildroot 时保留对内核文件的修改，而不会被覆盖。请确保在进行任何构建操作之前，备份你的修改以防止意外丢失。