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B-tree

目前支撑着数据库产业的半壁江山。

50 年来不变而且人们还没有改变它的意向

鉴定一个算法的优劣,有一个学派叫 IO复杂度分析 ,简单推演真假便知。

下面就用此法分析下 B-tree(traditional b-tree) 的 IO 复杂度,对读、写 IO 一目了然,真正明白读为什么快,写为什么慢,如何优化。

为了可以愉快的阅读,本文不会做任何公式推导,复杂度分析怎么可能没有公式呢!

读IO分析

这里有一个 3-level 的 B-tree,每个方块代表一个 page,数字代表 page ID。

上图 B-tree 结构是 内存 的一个表现形式,如果我们要读取的记录在 leaf-8上,read-path 如蓝色箭头所示:

root-9 –> branch-6 –> leaf-8 根-9 ->分支-6 ->叶-8

下图是 B-tree 在 磁盘 上的存储形式,meta page 是起点:

这样读取的随机 IO (假设内存里没有 page 缓存且 page 存储是随机的)总数就是(蓝色箭头):

1(meta-10)IO + 1(root-9)IO + 1(branch-6)IO + 1(leaf-8)IO = 4次 IO,这里忽略一直缓存的 meta 和 root,就是 2  次随机 IO。

如果磁盘 seek 是 1ms,读取延迟就是 2ms

通过推演就会发现,B-tree 是一种读优化(Read-Optimized)的数据结构,无论 LSM-tree 还是 Fractal-tree 等在读上只能比它慢,因为读放大(Read Amplification)问题。

存储引擎算法可谓日新月异,但是大部分都是在跟写优化(Write-Optimized)做斗争,那怕是一个常数项的优化那就是突破,自从 Fractal-tree 突破后再无来者了!

写IO分析

现在写一条记录到 leaf-8。

可以发现,每次写都需要先读取一遍,如上图蓝色路径所示。

假设这次写入导致 root, branch 都发生了变化,这种 in-place 的更新反映到磁盘上就是:

基本是 2  次读 IO和写 2  次写 IO+WAL fsync,粗略为 4  次随机 IO。

通过分析发现,B-tree 对写操作不太友好,随机 IO 次数较多,而且 in-place 更新必须增加一个 page 级的 WAL 保证失败回滚,简直是要命。

Write-Optimized B-tree 写优化B树

说到写优化,在机械盘的年代,大家的方向基本是把随机 IO 转换为顺序 IO,充分发挥磁盘的机械优势,于是出现一种 Append-only B-tree:

更新生成新的 page(蓝色)

page 回写磁盘时 append only 到文件末尾

无需 page WAL,数据不 overwrite,有写放大(Write Amplification)问题,需要做空洞重利用机制

Append-only B-tree 节省了回写时的 2 次随机 IO,转换为常数级(constant)的1次顺序 IO,写性能大幅提升,总结起来就是:

随机变顺序,空间换时间

LSM-tree, Fractal-tree 等写优化算法的核心思想也是这个,只不过其实现机制不同。

LSM-trees lsm树

随着 LevelDB 的问世,LSM-tree 逐渐被大家所熟知。

LSM-tree 更像一种思想,模糊了 B-tree 里 tree 的严肃性,通过文件组织成一个更加松散的 tree。

rockdb应用:

写入

先写入内存的 C0

后台线程根据规则(Leveled/Sized)进行 merge,C0 –> C1, C1 –> C2 … CL

写入 C0 即可返回,IO 放到后台的 Merge 过程

每次 Merge 是硬伤,动作大就抖,动作小性能不好,每次 Merge 的数据流向不明确

写放大问题

读取

读取 C0

读取 C1 .. CL 读取 C1 . CL

合并记录返回

读放大问题

Fractal-tree 分形树

终于发展到了“终极”优化(目前最先进的索引算法,本篇文章参考的是T okuDB 的 Contributor的文章,可能有点武断,个人想法没有最好的算法,只有最适合的算法,有时遍历也是最好的方案 ),Fractal-tree。

它是在 Append-only B-tree 的基础上,对每个 branch 节点增加了一个 message buffer 作为缓冲,可以看做是 LSM-tree 和 Append-only B-tree 完美合体。

相对于 LSM-tree 它的优势非常明显:

Merge 更加有序,数据流向非常分明,消除了 Merge 的抖动问题,大家一直寻找的 compaction 防抖方案一直存在的!

这个高科技目前只有 TokuDB  在使用,这个算法可以开篇新介,这里不做累述,感兴趣的可以参考原型实现 nessDB 

http://www.dinnco.com/news/16999.html

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